本发明公开了一种用于硬质河道的生物‑生态净化系统，包括微孔曝气系统和生物‑生态床系统。微孔曝气系统包括微孔曝气机、曝气主管和多根间隔地布设在河道底部的曝气支管；生物‑生态床系统包括多个木质框架和安装在每个木质框架上的生物组合填料和水生植物；多个木质框架沿着河道的水流方向间隔地设置在河道中；生物组合填料包括若干道絮状生物绳和若干组生物球；若干道絮状生物绳间隔地连接在木质框架的两侧竖杆之间；若干组生物球竖向交错地设置在相邻的絮状生物绳之间；水生植物依附若干个种植桶生长，若干个种植桶各自通过吊绳间隔地悬挂在木质框架的底横杆上。本发明能够有效去除水中的有机物及氮磷污染物，提高水体透明度。