本发明公开了一种嵌入式果树嫁接器及其工作方法，涉及嫁接用领域，包括壳体，所述壳体内设置有切割刀，所述切割刀用于在砧木和枝条上进行切割，在所述砧木上切割形成楔形口，在所述枝条上切割形成芽块，所述芽块的切口与所述砧木上的楔形口重合，采用对砧木和枝条切割相同的位置，使砧木和枝条上的切口相同，从而使枝条上芽块的切割面与砧木上的锲型口重合，从而达到高重合度的目的，同时采用机械的的方式进行取接穗作业，使在取接穗作业中，每个砧木上的锲型口与每个枝条上芽块的大小相同，即使其中一个砧木或枝条损坏，也能够与其余的枝条或砧木相配合使用。