本发明提供一种全定制在线智能口腔正畸诊疗单生成方法及诊疗系统，包括如下步骤：采集数据信息，建立与该数据信息相对应的个人数据库；其中所述数据信息包括个人信息数据和医疗数据；根据所述个人数据库建立对应的三维口腔模型；根据所述三维口腔模型生成诊疗方案模型，基于所述诊疗方案模型输出诊疗单；其中所述诊疗单内包含诊疗结果和诊疗计划数据。诊疗系统包括诊疗端子系统和制造端子系统；极大的方便了患者、正畸医生、正畸产品制造厂商，构筑了一个闭环生态系统，可最大化整个生态的运行效率，节省时间和支出。