本发明公开了一种防治根茎类药材病害的栽培基质及制备方法，属于中药材种植技术领域，包括以下原料：木质纤维、叶片破碎物、甘蔗渣、骨粉、核苷酸盐、中微量元素、硝吡咯菌素、福美砷、生石灰和硫磺。同时公开了利用堆沤发酵对上述原料进行制备得到栽培基质的制备方法。本发明提供的栽培基质能够有效的防治根茎类药材根茎部位疾病的发生，同时，本发明中的制备方法操作成本低，方法简便，易于规模化生产和推广，该生长基质对根茎类中药材无毒、无害，且无不良副作用；使药材增产、增收、增效，增强抗性，改善和提高品质。