本发明涉及一种防止汽车天窗漏水的系统及其方法、车辆，所述系统中电源供电模块供电连接单片机模块、空气泵模块；空气泵模块包括空气泵和气压传感器，空气泵的出气口接入天窗排水通道，单片机模块信号连接空气泵模块，通过空气泵送出的压力气体清洁天窗排水通道，从而保持天窗排水通道畅通；气压传感器实时检测空气泵送出气体的压力值并将压力值实时发送给单片机模块，单片机模块根据压力值判断天窗排水通道是否堵塞。本发明通过将一个空气泵与天窗排水通道串接，这样当天窗排水通道出现堵塞时，利用空气泵的高压力气流将进入到通道里的树叶、灰尘等堵塞物排出，从而保证天窗排水通道的顺畅，从根源上避免因天窗排水通道堵塞而造成座舱漏水。