本发明公开了一种量子物理孪生方法和系统，方法包括以下步骤：对待研究的完全封闭的微观动力学系统进行测量，获取数字化的由密度矩阵描述的微观动力学系统的初态；对于马尔科夫近似的情况，采用lindblad主方程描述所述微观动力学系统基于所述初态的演化，得到微观动力学系统的结果态；对所述初态和所述结果态进行应用。本发明提出了一种对应于微观系统的量子物理孪生体系，以孪生的思想在数字世界研究微观系统诸如量子光学、量子生物学、量子统计力学中的动力学过程，将微观体系作为数字模型来研究，并着眼于其应用。