本发明涉及稀土加工技术领域，具体为一种稀土颗粒分离系统，包括箱体、进水管、排水管、第一输送管、第二输送管、第一传动管和第二传动管，还包括：一号过滤模块与二号过滤模块设于箱体内部，且通过电机控制启动，用于过滤并筛选废水内的稀土颗粒；一号收集模块与二号收集模块设于箱体外部，通过第一输送管和第二输送管与过滤模块连接，用于对完成过滤的稀土颗粒进行收集；废水由进水管进入过滤桶进行过滤，使不同大小的稀土颗粒被筛选并分类收集在收集盒内，随后废水穿过第二传动管流动至排水管并排出箱体，减少了稀土颗粒无效流失的问题，改善了稀土资源浪费的情况，增强了稀土颗粒分离系统的生产效率，提高了稀土资源的利用率。