本发明涉及基于图像处理的花生选种方法，属于花生批量选种技术领域。方法包括以下步骤：将各目标图像中各灰度值对应的异常程度进行排序，得到各目标图像对应的异常程度序列；依次判断异常程度序列中的各异常程度是否大于预设异常程度阈值，若是，将对应的异常程度剔除；将每次剔除之后的异常程度序列记为各目标图像对应的异常程度子序列；根据各异常程度子序列，得到各目标图像对应的各异常程度子序列对应的平均异常程度；根据各目标图像对应的灰度直方图，得到各目标图像对应的各异常程度子序列对应的目标概率；根据平均异常程度和目标概率，得到目标批次对应的花生种子。本发明能够提高花生选种的效率。