本发明公开了一种水库天然饵料采集培育大规格鱼苗的方法，涉及水产养殖技术领域，解决水库放养鱼苗太小成活率低或放养鱼苗太大成本高的技术问题，方法包括：在水库中设置鱼种培育网箱，并在鱼种培育网箱放养幼小鱼苗；将水库的水深划分为多个深度层，检测各深度层的浮游动物量；抽取浮游动物量最高的深度层的浮游动物，并输送到鱼种培育网箱；幼小鱼苗经过设定时间培育或长到设定重量后，直接放入水库中继续培养得到鱼产品。本发明还公开了一种实现上述方法的系统。本发明可以在大水面水库里以无投饲料方式培育大规格鱼种，培育成活率高，培育后可真接放入水库，节约成本，操作方便。