本发明涉及指纹识别技术，旨在提供一种基于指纹声波的身份认证方法及系统。包括步骤：用户将手指的指腹放在摩擦材料上，在其表面滑动多次，麦克风录制手指活动过程中的摩擦声音；对采集到的声音信号进行降噪处理，截取去噪后的滑动摩擦音频信号；对截取的音频信号进行特征提取，获得基于指纹特征的三级音频特征；利用集成分类学习方法，以多个分类器对提取到的音频特征进行融合、分类与预测；根据权重对预测结果投票，得到用户身份认证结果，加认证结果进行存储。本发明能确保指纹认证只能基于现场活体识别，在保护用户隐私的同时极大增强了安全性；只需麦克风就能获取到用户的指纹信息，可最大程度节省硬件成本和空间，具有很好的工业应用前景。