本发明提供了一种远程操控船型生态浮床及其在处理酸性重金属废水中的应用，涉及重金属废水处理技术领域。本发明提供的浮床中的船头工作区包括船身基体和太阳能电池板顶棚，船身基体的甲板上设置有GPS信号接收反射器和信号处理控制器；船尾工作区包括船身基体和太阳能电池板顶棚，船身基体的甲板上设置有蓄电池和电机，船身基体的水下部分设置有电螺旋桨；生态浮床主体工作区的上部主体工作区包括植物工作区和环绕在植物工作区四周的藻类工作区，下部主体工作区包括厌氧菌工作区和环绕在厌氧菌工作区四周的好氧菌工作区。本发明提供的浮床不仅能够实现动力能源自给、可受控制定点移动，而且能对酸性重金属废水进行有效处理。