本发明涉及一种自动关闭车窗系统及方法，系统包括设于汽车上的外界感知系统、车身控制系统、玻璃升降电机和车窗玻璃；玻璃升降电机与车窗玻璃驱动连接；车身控制系统与外界感知系统、玻璃升降电机信号连接；外界感知系统用于采集汽车外界路面是否有积水和周边是否有车辆经过的外界路况信息，并将外界路况信息传递给车身控制系统，当车身控制系统判断外界路况信息为汽车外界路面有积水且周边有车辆经过时，则判定需要关闭车窗玻璃并输出控制信号至玻璃升降电机，玻璃升降电机驱动车窗玻璃升起至关闭状态。本发明可以在设定的条件实现自动关闭车窗；车辆在行驶过程中，自动关闭车窗的功能，让驾驶员能够专心开车，提高安全性。