本发明公开了一种基于补碳柱的潜流人工湿地河水处理方法，包括：S1、制备碳源：除去植物表面的污染物，称取当地作物，烘干至恒重后取出，在25℃条件下采用质量分数为2％的NaOH溶液中浸泡24h，制得固体碳源材料；S2、装填补碳柱：将固体碳源材料装填入补碳柱；S3、建立治理区溶质运移模型：①建立溶质运移模型；②溶质运移模拟；S4、布置补碳柱：基于溶质运移模型，在治理区内从上游至下游布置定位点，使得整个治理区内碳源运移浓度大致均等。本发明以补碳柱的形式将碳源植入人工湿地，可以降低工程难度，便于后期更换或补充碳源，通过溶质运移模型布置补碳柱，可以合理规划布局，使得环境范围内碳源运移更为均匀，提高脱氮效率。