本发明公开了一种基于临床医嘱的患者膳食订餐方法及系统，包括步骤a.判断患者是否在预设点餐时间内根据医嘱按时点餐，若患者按时点餐，则生成统计报表；步骤b.根据统计报表的统计结果，对超时未点餐的患者进行自动配餐；对已点餐的患者，配餐患者指定膳食，并打印患者指定膳食标签，患者指定膳食标签记录有患者当前医嘱；步骤c.查询在预设医嘱查询时间段内是否有医嘱更新，若有医嘱更新，则最新医嘱替换当前医嘱；根据最新医嘱自动匹配对应的更新膳食，用更新膳食替换患者指定膳食；更新患者指定膳食标签的内容形成并打印更新膳食标签。通过查询膳食医嘱更新情况，保证患者及时获取最新医嘱以订餐和进餐，进而达到降低医疗风险，加快康复的效果。