本发明公开了一种智能选频微波水分测量仪，包括测量设备与智能测量分析系统，所述测量设备包括控制柜、两个竖直支架，两个所述竖直支架的相对侧壁支架固定连接有下水平支架与上水平支架，所述下水平支架与上水平支架上分别安装有微波发射探头与微波接收探头；所述智能测量分析系统包括设置在控制柜内的RAM微处理器微型工业电脑。本发明通过基于相位差和阻尼衰减两者计算出来一个计算量，并引进人工智能算法和大数据分析，对水分含量的变化有明显的响应，故不需进行高度补偿、密度补偿以及温度补偿就能实现精确测量，因此无需配备额外的补偿用的温度传感器或者高度传感器。