本发明公开了一种草本抗炎透皮吸收微乳凝胶及其制备方法，本发明使用蔗糖‑椰油酸酯与肉豆蔻酸异丙酯对京尼平苷进行包覆并形成京尼平苷乳液；将海藻酸钠经醛化处理后，通过羰基与含有氨基的硅烷发生亲核加成反应以制得杂化聚合物溶液；将所述京尼平苷乳液与所述杂化聚合物溶液在酸性条件下经冷却胶凝制得所述草本抗炎透皮吸收微乳凝胶。本发明具有良好的透皮效果，使抗炎活性物质能够有效通过皮肤角质层，同时具有良好的延展性，能够与皮肤的贴合更加紧密，进而有利于抗炎活性物质的释放；京尼平苷能够长期有效地从微乳凝胶中释放，延长了抗炎的有效时间。