本发明涉及一种多用途海洋观测仪器的保护装置，包括浮台、观测仪和保护机构，所述浮台顶部安装有观测仪，且观测仪外侧且位于浮台上安装有保护机构，所述保护机构包括固定底罩、活动中罩和活动顶罩，所述固定底罩与浮台固定安装，所述固定底罩内滑动安装有活动中罩；固定底罩、活动中罩和活动顶罩罩在观测仪外侧，通过马达带动转轴旋转，此时转臂带动盖板旋转至盖在通槽上，进而通过保护机构罩在观测仪外侧，对观测仪进行保护，避免外界环境对观测仪造成损坏，且通过电机再次工作，将固定底罩、活动中罩和活动顶罩处于折叠状态，且盖板旋转为竖直状态，便于观测仪进行海洋观测。