本发明公开一种基于端口选择性加密的视频安全接入方法及系统，包括视频终端、安全网关和视频主站；视频终端通过VPN客户端与安全网关之间进行协商认证，建立SSLVPN隧道；安全网关向视频终端的VPN客户端推送端口加密配置信息，VPN客户端存储不加密端口范围信息；视频业务客户端按照预先配置的目的端口与数据类型的映射关系确定视频信令数据或视频流数据的目的端口，组装视频信令数据包发送至VPN客户端；VPN客户端获取数据包中的目的端口信息，判断数据包是否需要加密，对视频信令数据包进行封装加密，对视频流数据包直接封装后发送至安全网关；安全网关接收加密视频信令数据包或明文视频流数据包后，判断所接收到的数据包的加密类型，将数据明文转发至视频主站。本发明能够基于端口对视频终端据进行选择性加密传输，保障数据的安全性及视频数据传输的效率。