本发明公开了一种固相微孔反应器洗头装置及使用方法，包括：一顶部开口且中空的固相微孔，微孔孔腔的底面设置有一增益结构；洗头注液结构，深入微孔孔腔内并与微孔孔腔内侧壁保持一定的间距，形成洗液腔；废液吸排结构，废液吸排结构包括一位于微孔孔腔与洗液腔形成的冲洗区内的废液导出腔，废液导出腔探入微孔孔腔内的侧壁轴向连接有一外延沿，外延沿的形状适配增益结构的形状，将洗头注液结构与废液吸排结构结合在一起后移动至固相微孔内，能够同步进行冲刷、抽吸动作或者快速交替进行，能够在短时间内快速完成冲刷和抽吸的动作，相比于现有的间歇性抽、加液的两步交替进行的洗涤方式，缩短了清洗的时间，提高了工作的效率和效果。