一种具有控温功能的多通道生物反应器及其控温方法，属于生物反应器技术领域，为了利用解决现有的生物反应器无法进行多通道进行同时进料，导致进料过程繁杂且无法做到无菌进料，现有的生物反应器内控温效率差，影响其反应效率，导致效率慢。通过搅拌电机带动搅拌杆转动的情况下带动生物物料快速融合由搅拌杆搅拌提高反应速度，也增加反应的均匀性，保证其生产效率，由控温器对上加热环和底加热环进行温度调控，从而对内部温度进行调控，有效保证内部温度的精确性，可根据需要对温度进行调控，电磁阀进行启闭，有效保证多种物料进行进料，在进料罐进料后，将下方的电磁阀关闭，保证进料箱内密封，防止在进料时，混入杂质。