本发明提供了一种考虑双层碳排放优化分配模型的区域多系统双层分散优化调度方法，构建了一种区域多能源系统双层碳排放优化分配模型，上层区域多能源主系统主要考虑了配电网、配气网和配热网系统，基于实时环境监测而制定其实时碳排放约束，按照下层区域内各多能源子系统的历史碳排放量实时分解给下层区域内各多能源子系统，并且下层区域内各多能源子系统在优化的同时需满足其实时碳排放约束；最后采用改进的目标级联分析法来求解上层和下层之间区域多能源系统的双层分散优化调度模型。本发明既能降低区域多能源系统上层配网系统的总网络损耗，又能减少下层区域内各能源子系统的运行成本，同时确定区域多能源系统整体碳排放量的最优分配方案。