本申请公开了一种基于检测虾肝肠胞虫感染量的南美白对虾养殖方法，属于南美白对虾养殖技术领域；该方法在整个南美白对虾养殖期定期监测肝肠胞虫的感染量，病针对不同的感染量，采用不同的养殖措施。本申请中选取优质虾苗进行集中标粗，定期监测包括肝肠胞虫在内的病原指标，经一个月左右标粗，各项检测合格以后再分池养成，相比虾苗直放该技术一方面集中管理降低成本，另一方面可降低因苗种低携病率漏检造成后期养殖的风险。在养殖期随时观察虾的活力和摄食生长情况，定期进行肝肠胞虫病原的监测，若检测出现阳性辅以实时荧光定量检测，根据养殖时期、虾的规格状态和定量检测数据，按本申请的方法进行处理，降低经济损失。