用于检测肿瘤新抗原负荷的方法、计算设备和计算机存储介质
实质审查的生效
摘要
本公开涉及一种用于检测肿瘤新抗原负荷的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括：获取关于肿瘤样本的转录组序列以及与参考基因组比对的第一比对结果信息和剪接位点信息；获取关于配对正常样本的全外显子组序列以及与参考基因组比对的第二比对结果信息配对正常样本的全外显子组序列；基于第一比对结果信息和第二比对结果信息，生成体细胞突变信息；确定特异性HLA基因型；基于剪接位点信息和特异性HLA基因型，生成关于特异性新抗原的第一结果；基于体细胞突变信息和特异性HLA基因型，生成关于特异性新抗原的第二结果；以及基于第一结果和第二结果，生成检测对象的肿瘤新抗原负荷。本公开能够有效提高检测肿瘤新抗原负荷的全面性和可靠性。
基本信息
专利标题 ：
用于检测肿瘤新抗原负荷的方法、计算设备和计算机存储介质
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114464256A
申请号 ：
CN202210125355.8
公开（公告）日 ：
2022-05-10
申请日 ：
2022-02-10
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
李海波王堃魏金旺王冠
申请人 ：
领星生物科技（上海）有限公司;上海领安生物科技有限公司;启东领星医学检验实验室有限公司
申请人地址 ：
上海市浦东新区祥科路111号腾飞科技楼2号楼5楼
代理机构 ：
北京市金杜律师事务所
代理人 ：
张平
优先权 ：
CN202210125355.8
主分类号 ：
G16B20/30
IPC分类号 ：
G16B20/30 G16B20/50 G16B30/10
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B20/00
特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如基因型-表型关联的ICT
G16B20/30
结合位点或基序检测
法律状态
2022-05-27 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 20/30
申请日 : 20220210
申请日 : 20220210
2022-05-10 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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