一种基于流量小、扬程变幅大的泵站布置结构，在挡水建筑物上设置进水口；进水口通过输水管连接至输水管闸阀室；在泵站的内部设有多个承压腔体，每个承压腔体内设置有潜水轴流泵，各个潜水轴流泵的扬程不同；潜水轴流泵的出水端通过管道连接至高位水池；各个承压腔体分别通过承压腔体输水管连接至输水管闸阀室；在泵站的内部还设置有离心泵，离心泵的出水端通过离心泵出水管连接至高位水池；离心泵的进水端通过离心泵进水管连接至输水管闸阀室；在输水管闸阀室内设置有闸阀用于控制输水管与其中一个承压腔体的输水管连通、或者与离心泵进水管连通。不同扬程的潜水轴流泵及离心泵组合设计，有效利用水库水压的同时，降低运行期运行费用。