本发明公开了一种手术抗菌药物用药合理性审核系统，包括审核终端和操作终端，审核终端包括服务器安装机构以及分布在服务器安装机构内部的审核服务器，审核服务器与操作终端数据相连，审核服务器包括数据接收模块、手术数据库、数据匹配模块、数据计算模块、数据调取模块、用药数据库、用药判断模块，操作终端包括信息统计模块。本发明帮助医生判定手术是否属于Ⅰ类切口手术，规避了可能出现的记忆错误；帮助医生判定病人是否存在Ⅰ类切口手术感染的高危因素，减少了医生主动勾选的工作、提高了判断的准确率；规避了医生主动勾选错误的高危因素导致抗菌药物的使用；帮助医生判断所选抗菌药物是否正确。