本发明公开了一种电动车控制器功能端口配置方法、装置及控制设备，其中方法包括：获取电动车控制器功能端口的配置需求信息；对所述电动车控制器的多个端口进行初始化处理；根据所述配置需求信息调用预存的端口配置数据；通过所述端口配置数据对多个所述端口进行配置。根据实际生产需要确定所需的端口个数以及端口功能种类，预先制定端口配置方案，根据这些功能需求，调用预存的配置数据，对这些端口对应地配置端口协议。