本发明公开了一种基于高通量测序子宫内膜癌分子分型的文库构建方法，属于生物技术领域。本发明基于多重PCR的扩增子靶向高通量测序，同时对11个基因突变和10个微卫星位点检测微卫星不稳定状态进行检测，根据检测结果评估内膜癌患者分子特征。本发明最低能稳定检出5ng/μL样本中2％突变比例和肿瘤含量为5％的微卫星不稳定状态，分型结果准确性更高；本发明检测的基因数目更多，可获得更多的肿瘤突变信息；本发明文库构建过程仅需3～5小时，操作简便、成本低廉；本发明仅通过一次检测即可完成子宫内膜癌的分子分型。本发明更适合临床应用，能更好地辅助医生评估患者预后、调整临床治疗方案，还能满足遗传性子宫内膜癌的筛查等。