本发明公开了一种赤泥渗滤液生化处理系统及处理方法，处理系统包括依次设置并顺序对渗滤液进行处理的固液分离单元、用于分离活性污泥的高盐生化反应单元、用于氧化降解高分子有机物的臭氧催化氧化塔、用于降解有机物并截留悬浮固体的SBAF生物曝气滤池、用于过滤的单阀过滤器和用于储存处理后的清水的清水池，还包括用于处理所述固液分离单元、高盐生化反应单元分离出的污泥的污泥处理单元。通过本发明处理赤泥渗滤液，反应效率高，处理效果稳定，可以有效的去除赤泥渗滤液废水中的COD、F、氨氮、TP、硫化物，高标准的满足地表Ⅳ类水质的要求，并极大的降低处理成本，减少药剂污泥的产生量。