本发明公开了一种诊间自助支付终端系统，包括，医师处理模块、账单接收模块、账单处理模块、用户自助模块和存储模块，医师处理模块将处理完的医疗清单发送至账单处理模块，账单处理模块接收到医疗清单后将账单进行分类，并输入账单处理模块中，账单处理模块将账单费用进行计算统计，并通过账单发送模块发送至用户自助模块和存储模块中，使用者可通过用户自助模块中的终端显示模块进行账单查询和支付操作，存储模块接收来自账单发送模块的信息，并将其存储在云端存储模块和本地存储模块中。本发明能够快捷支付病人的医疗费用，节约排队等候时间，终端入口含有多个可供选择，且信息透明度高，安全性更高。