本发明涉及一种用于人工瓣膜的心包筛选系统及方法，属于医疗器械技术领域。包括操作台、心包放置架、轨道式三维扫描仪、图形处理计算机以及投影仪；操作台的一端设有心包放置架，心包放置架上设有待测量的心包组织；心包放置架一侧的操作台上设有朝向待测量心包组织的轨道式三维扫描仪和投影仪；操作台上还设有图形处理计算机，图形处理计算机分别与轨道式三维扫描仪和投影仪连接；图形处理计算机内安装有三维模型生成软件和厚度峰谷图生成软件。本发明通过三维扫描仪对心包组织的厚度进行测量，以非接触式的厚度测量方式最大程度地降低对心包组织造成的额外损伤；通过投影仪将厚度峰谷图投影至心包组织上，使裁切处理更为便捷，筛选效率高。