本发明专利公开了一种基于BIM实施医院建筑机电系统改造的施工方法，医院建筑的构造包括地下室、旧机房、旧机电系统、新机房、新机电系统、一层诊疗空间、二层诊疗空间、三层诊疗空间、中间层诊疗空间、次顶层诊疗空间、顶层诊疗空间、新竖向管井和旧竖向管井。本发明应用BIM技术精细化模拟分析新机电系统安装和旧机电系统的拆除，由远到近、逐层、分区域进行施工，从而实现机电设备管线保持“新旧双系统同时运行”，在实施新旧机电系统替代的同时保持医院建筑大修改造“施工不停诊”，保持了医院诊疗活动的流畅性，使得大修改造对医院诊疗服务的数量和质量影响极小，产生良好的社会效益和经济效益。