本发明涉及湿地沉积物检测技术领域，尤其涉及一种湿地沉积物深层取样装置，包括安装座，所述安装座的外壁设置有立杆，且立杆的端部设置有固定板，所述固定板的外壁设置有驱动件一，且驱动件一的驱动端设置有丝杆，所述丝杆的外壁设置有升降板，所述升降板上贯穿固定设置有取样筒，所述取样筒的外壁设置有气泵，且气泵的通气端通过连通管和取样筒相连通，所述安装座的外壁开设有和取样筒相配合的固定口，且安装座外壁的四个拐角处均设置有浮块，还包括：取样机构，所述取样机构设置于取样筒中，用于将沉积物收集至取样筒中；行进机构。本发明有效避免其他深度的沉积物进入取样筒中，有效实现了定深定点取样，使用效果更佳。