本发明属于微生物发酵技术领域，尤其为一种基于云端控制的高效发酵系统，包括温度传感器组、管理控制模块、云端管理平台、比较服务器和综合评价系统，所述综合评价系统运用大数据分析结果，对经第一温度传感器或第二温度传感器检测到的温度数据进行综合评价，并将综合评价结果传输给管理控制模块。本发明采用双温度传感器获取双份发酵温度检测参数，利用比较服务器对双份发酵温度检测参数进行比对分析，实现对温度传感器组工作状态异常检测，能够及时发现并反馈传感元件的异常问题，并进行主辅温度传感元件替换，保证发酵温度监测的正常进行，基于大数据分析实现对当前发酵温度的最佳调控，进一步保证发酵质量及效率。