本申请公开了基于微内核架构的量子计算机操作系统及量子计算机，其中，量子计算机为异构量子计算机，异构量子计算机包括量子处理器部分和经典处理器部分，本申请通过将内核对象管理模块和数据传递模块配置于内核空间，将其他的系统功能模块移到用户空间，最小化内核空间中的功能结构，并通过内核对象管理模块创建IPC通道，通过IPC通道和数据传递模块实现量子计算机的消息传递和远程内存访问，避免了用户态和内核态切换的开销。本申请采用微内核架构来设计量子计算机操作系统，最小化了操作系统内核空间中的功能结构，其具有开销小、可靠性高、安全性好等优点，通过该量子计算机操作系统控制异构量子计算机，提高了异构量子计算机的效率和性能。