本发明公开了一种医联体系统的新生儿转运箱的负压隔离机构，包括底座，所述底座的底部滑动连接有定位机构，所述底座的表面滑动连接有升降机构，所述升降机构的内壁滑动连接有密封单元，所述底座包括支柱，所述支柱的顶部固定连接有床体，所述床体的内侧固定安装有空气处理装置。本发明通过螺纹杆啮合螺纹块内部的螺纹，螺纹杆转动带动螺纹块做线性运动，螺纹块带动第二导块沿着导轨向内运动，第二导块带动联动杆绕着铰栓做向上的摆动，同时第一导块向内滑动，此时，联动杆在绕着铰栓转动的同时，第二导块给导轨一个向上的推力，导轨推动活动底盘向上运动，从而达到婴儿在长途转运途中，需要紧急救助时，方便医护人员的救助。