本发明公开了一种古圆柏、侧柏复壮基质的制备方法，包括以下步骤：将粉碎后的树木枝条与豆粕、泥炭、发酵菌剂、磷矿粉、树木落叶进行混合发酵；收集动物毛发，清洗并消毒杀菌，装塑料袋密封保存7天以上备用；制作功能性牡蛎壳粉基缓释微粒并将其与麻酱渣掺混后挤压造粒；按照质量比将硫酸亚铁水合物、硼砂、硫酸锌水合物、硫酸锰水合物、钼酸铵、稀土、木质素及麻酱渣进行混合挤压造粒；将所得物料进行混合，然后避光保存即得古圆柏、侧柏复壮基质。本发明将多种生物质材料、矿物养分、生长调节物质、微生物菌剂经过创造性改造形成了一种生物活性强，速效养分与迟效养分协同，矿物养分、有机养分及功能物质缓释增效的集成体系。