连续流AOA短程硝化与内源短程反硝化双耦合厌氧氨氧化实现污水深度脱氮的方法与装置属于污水生物处理领域。装置包括城市生活污水原水箱、连续流AOA反应器、沉淀池。方法是城市生活污水泵入连续流反应器后以厌氧、好氧、缺氧模式运行，厌氧区储存内碳源并释磷，好氧区发生短程硝化厌氧氨氧化作用并吸磷，缺氧区发生内源短程硝化厌氧氨氧化作用，好氧区以及缺氧区分别投加悬浮以及固定生物载体，以持留富集厌氧氨氧化菌，最终分别在好氧区及缺氧区内实现厌氧氨氧化的双耦合，提高脱氮除磷效率。本发明无需严格抑制NOB即可实现主流厌氧氨氧化，且好氧区厌氧氨氧化的实现能够有效减少曝气需求、降低能耗。