本发明公开了一种多个入钞口智能配钞机，包括入钞系统、传输通道、鉴伪机构和出钞机构，所述入钞系统包括多个入钞机构，每个入钞机构具有一个入钞口；所述传输通道与各入钞机构分别对接以输送由各入钞口进入的钞币；所述鉴伪机构设于传输通道上以接收来自于传输通道输送的钞币并对钞币进行鉴伪；设于鉴伪机构的后端以将鉴伪后的钞币送出到预定出口端。该智能配钞机具有多个入钞机构，具有多个入钞口同时进钞，能快速高效地进行配钞，对于数量较少的配钞需求，甚至可以一次性快速配好钞，即使是大额钞币，也能以高于传统数倍的速度进行配钞。而且，多个入钞机构共用传输通道，互不干涉，充分利用传输通道，提高传输效率和利用率，提高配钞效率。