本发明提供了一种定子双绕组式双馈风机低电压穿越控制系统及方法，属于风力发电控制技术领域，具体的，所述系统包括：电压检测模块，被配置为：检测电网侧电压，并将检测到的电网侧电压发送给低电压穿越控制模块；低电压穿越控制模块，被配置为：当电网侧电压小于第一预设电压且大于第二预设电压时，转子侧变流器闭锁，转子回路的撬棒保护装置工作，且控制双变流器的中间母线与第一超级电容接通；当电网侧电压小于第二预设电压时，转子侧变流器闭锁，控制双变流器的中间母线与第一超级电容接通；本发明避免了转子侧转子过电流和直流母线过电压的影响，极大的提高了发电系统的稳定性。