本申请提供一种有机硅生产中废碱液的排污方法和系统，包括：将二甲基二氯硅烷的水解产物输送至搅拌釜内，通过循环泵将无机碱液从碱液储罐中泵至搅拌釜内，其中，循环泵连接在碱液储罐与搅拌釜之间，无机碱液与水解产物在搅拌釜中混合以去除水解产物中的氯化氢，获得混合液，将混合液在相分离器中分层，其中，相分离器连接在碱液储罐与搅拌釜之间，将下层碱液输入至碱液储罐内，以便通过循环泵再次泵至搅拌釜内，当碱液质量浓度小于等于2％时，通过排污泵将碱液泵送至污水处理装置。本申请实现了对二甲基二氯硅烷水解产物进行碱洗的过程中对废碱液排污的目的。