本发明公开了一种气液分离器和制氢系统，气液分离器包括：具有内腔的分离器本体；至少一个隔板，隔板设置于内腔且将内腔分隔为至少两个腔体，至少一个腔体为第一腔体，至少一个腔体为第二腔体，第一腔体用于第一气体气液分离，第二腔体用于第二气体气液分离。上述气液分离器应用于制氢系统，则能够在一个气液分离器内既实现对氢气混合物的气液分离，也能实现对氧气混合物的气液分离，较现有技术采用一个气液分离器进行氢气混合物的气液分离以及采用另一个气液分离器进行氧气混合物的气液分离相比，有效降低了气液分离所占用的空间，降低了管道和气液分离器的布置难度，还降低了气液分离所需的成本。