本申请提供一种栓塞微球及其制备方法和应用，属于栓塞剂技术领域。一种栓塞微球的制备方法包括将水相溶液与油相溶液混合形成油包水的反相悬浮聚合体系，并在40～80℃的温度下保持搅拌反应至少3h。水相溶液包括水溶性高分子化合物、水溶性单体、引发剂、交联剂和水，水溶性高分子化合物具有裸露的羟基，且水溶性单体同时带有离子官能团和不饱和键，交联剂同时带有缩醛结构和不饱和键。离子官能团为羧酸根和/或磺酸根。油相溶液包括油溶性分散剂和油性溶剂。本申请的栓塞微球的制备方法简便，合成周期较短，仅通过一步法即可合成栓塞微球，且在合成过程中杂质引入较少。