本发明提供了一种便携式真菌鳞屑标本采集器，涉及真菌采集技术领域，包括底座，所述底座为箱体结构，且底座的底端面上开设有纵向槽，在底座的顶端固定连接有盖板，底座与盖板之间固定连接有隔板，隔板的内部开设有通槽，解决了现有的在需要进行后续检测工作时需要反复的对样本进行采集，进而造成了工作效率的低下的问题，通过限位架的倾斜面与刮刀内部所开设的缺槽进行卡合使得刮刀在展出后可以进行更加有效的限位操作，有效的代替了传统的需要进行持续的按压才能使得刮刀凸出底座而造成的使用不便，并且薄膜在进行覆盖时可以通过弹簧柱对推板的挤压使得可以在减少接触的同时确保对刮刀的有效密封。