本申请提供一种基于头颅侧位的增强现实显示方法、系统及存储介质，所述方法包括以下步骤：获取由目标人员的多个X线片特征构成的X线片特征集合；基于增强现实设备显示的目标人员的真实头部的影像确定侧位面部特征集合；对所述X线片特征集合与所述侧位面部特征集合进行配准定位以确定头颅侧位增强影像与目标人员的真实头部的映射关系；基于所述映射关系在增强现实设备中将所述头颅侧位增强影像叠加显示到目标人员的真实头部的影像上。本申请提供的方法能够实现颅面部侧位组织结构特征的丰富、直观、动态及互相联动的显示效果，并辅助进行头影测量以获取更多维度的测量结果。