本发明提供一种含有榨菜IFL1启动子融合GUS基因的表达载体及其应用。本发明涉及一种榨菜IFL1基因启动子，核苷酸序列为如SEQ ID NO.3所示的核酸序列；或由SEQ ID NO.3所示的核酸序列衍生的具有同等功能的序列。本发明还涉及榨菜IFL1基因启动子在驱动目的基因表达中的应用。本发明启动子可以驱动GUS基因在烟草中的表达，可作为体外研究榨菜基因表达的理论基础。本发明启动子序列位于IFL1基因上游，可启动IFL1基因的表达，同时在序列上存在多个激素和胁迫位点，可通过激素或胁迫处理调控IFL1基因表达，调控榨菜生长发育及维管束形成。本发明有利于对榨菜生长发育及维管束形成发育调控机制的深度研究，在榨菜遗传改良及分子育种上具有广阔的应用前景。