本发明涉及一种域内路由选择优化方法及系统，利用各路由器节点的路由表建立关联的路由回溯表，并以此表作为数据挖掘对象，采用Apriori算法逐层挖掘频繁出现在路由路径中的主干路由节点，以所有主干路由节点组建成的主干链路即为域内网络的结构中心，通过主干链路对网络自治系统内的数据进行分流，从而提高链路带宽和数据吞吐量，减少拥塞问题在繁忙路径发生的频率；将剩余的普通路由器节点按照其与主干路由器节点的相邻距离，以主干链路为中心由近及远的为所有普通路由器节点确立直接或间接的强连接关系，使得在支持路由最短算法原则下，将部分数据流量分配到主干链路上，进一步减小窄带路径上负载的压力。