本发明涉及一种滨海地区潮汐影响下的抗性基因研究方法及固相萃取仪，该方法包括滨海地区布设采样点，大潮和小潮后，在采样点采样表层和浅层两个深度的样品，将样品冷藏带回实验室用于理化分析和研磨后进行固相萃取，质谱分析得到滩涂各点位样品抗生素种类、回收率与检出限；以及对样品的抗性基因种类、丰度进行定量，为抗性基因在潮汐影响下的分布特征、抗性基因与移动遗传元件的研究提供价值数据。本固相萃取仪的进样水槽分割呈多个扇形的隔间，便于同时进行多组样品萃取，提高前处理效率。