本发明公开了一种经颅磁刺激线圈连接器，包括第一接头和第二接头，第一接头与第二接头插接；第一接头包括依次设置的水管公头、信号线插针、电源线插孔，第二接头靠近第一接头一侧包括依次设置的水管母头、信号线接触孔及电源线插针。通过设置第一接头与第二接头插接，第一接头和第二接头上均集合了电源插头、信号线插头以及水管插头，用户只需要一个接头即可完成对电源、信号以及水管线路的接通，统一三种连接线的长度，结构紧凑、体积小、质量轻，同时，将液冷管路连接头与电路端连接头合并为一个整体，不受限于原液冷管路端插头与电路端插头之间线路及管路的长度，可考虑将经颅磁刺激仪与液冷机箱合并，适用性更广。