本发明公开了一种铂金通道冷却段顶部的电偶保护结构和方法，包括热电偶填充层、异型保护套管和系统填充层；所述异型保护套管设置在热电偶的外侧，异型保护套管固定在冷却管本体上，所述异型保护套管和热电偶之间设置有热电偶填充层，热电偶填充层进行灌浆填充；所述异型保护套管包括偶丝垂直管与底座，所述底座固定设置在冷却管本体上，底座中心设置有通孔，热电偶穿过通孔连接冷却管本体，偶丝垂直管固定在底座的通孔上，所述系统填充层设置在底座和冷却管本体的表面。进行了全面的独立式隔绝和密封，实现了偶丝与冷却扁管的整体性和偶丝自身的全面抗氧化性。