本发明涉及波浪能发电技术领域，提供了一种基于磁流体发电的振荡水柱式波浪能转换系统，至少包括：浮体，包括密封端与敞口端，敞口端适于伸入水体内，以使浮体内部介于水面与密封端之间的区域形成气室，气室具有与外界相连通的气体通道，气室内设置有磁场；振荡空间，设置在气室内，且能够发生形变；振荡空间内填充有液态金属，振荡空间适于在受到气流冲击时发生形变以使液态金属流动切割磁场产生电流。该转换系统中，振荡空间在受到向上或者向下的气流冲击时均可以发生形变以使液态金属流动切割磁场产生电流。相较于传统旋转透平发电机而言，无需设置单向阀整流系统，结构更精简、更容易维护、成本更低，有利于大范围推广使用。